Los invertebrados constituyen el grupo de mayor número tanto en diversidad biológica, como en número de especies y ambientes colonizados. En la colección del Museo de La Salle, que cuenta con 65.841 ejemplares, los cuales se pueden diferenciar en dos grandes grupos: los artrópodos que son los invertebrados que presentan un esqueleto externo articulado, como por ejemplo los insectos, cangrejos, arañas, ciempiés y alacranes; y los invertebrados no artrópodos, que carecen de exoesqueleto como muchos gusanos o poseen caparazones externos como en el caso de almejas, caracoles, estrellas y erizos de mar.  

En la Colección de Invertebrados del Museo de La Salle, los departamentos que mayor número de registros presentan son Cundinamarca, Casanare, Valle del Cauca y Tolima.

Si bien los artrópodos están presentes tanto en los ambientes acuáticos como en los terrestres, la mayoría de los invertebrados no artrópodos sólo viven en el medio acuático o en medios terrestres muy húmedos.