Dada la antigüedad de los ejemplares que aquí se encuentran, a través de los individuos se pueden identificar los diferentes tipos de técnicas que se implementaron a lo largo del siglo XX para preservar ejemplares biológicos. Así mismo, se destaca que parte de sus organismos, son el único registro de las especies que alguna vez vivieron en las proximidades de lugares como Bogotá, Cúcuta, Pamplona, Medellín, Villavicencio, Leticia, Florencia, y que probablemente, ya estén extintas localmente.

En la actualidad el museo posee 87 tipos y un total de 32.305 individuos repartidos en 11 colecciones de la siguiente manera:

• Peces
• Ranas
• Salamandras
• Cecilias
• Ofidios
• Saurios
• Cocodrilos
• Tortugas
• Aves
• Murciélagos
• Mamíferos